Pozornost je věnována zejména těm nebezpečným látkám Seznamu I (zvlášť nebezpečné závadné látky), pro které Evropská unie resp. nařízení vlády č. 61/2003 Sb. předepisuje mezní hodnoty ve vypouštěných odpadních vodách podle druhu výrob a rovněž indikační a mezní hodnoty ve vodách povrchových. Tyto nebezpečné látky jsou hlavním předmětem zájmu, jelikož se k jejich použití a vypouštění do vodního prostředí váže celá řada konkrétně stanovených požadavků. Jedná se o těchto 17 látek:
Seznam ostatních nebezpečných závadných látek byl sestaven s ohledem na „Program na snížení znečištění povrchových vod nebezpečnými závadnými látkami a zvlášť nebezpečnými závadnými látkami“, který byl přijatý usnesením Vlády České republiky č. 339 dne 14.4.2004. Bylo přihlíženo taktéž k Rámcové směrnici 2000/60/ES (podzim roku 2000), ustavující rámec pro činnost Společenství v oblasti vodní politiky (32 tzv. prioritních látek). Ustanovení seznamu prioritních látek v oblasti vodní politiky bylo stvrzeno Rozhodnutím Evropského parlamentu a Rady ze dne 20.11.2001 č. 2455/2001/ES. Jeho součástí je i většina ze 17 výše uvedených látek.
Do celkového výběru jsou zahrnuty i další ze zbývajících látek Seznamu I a látky Seznamu II Směrnice Rady 76/464/EHS. Seznam II obsahuje skupiny látek, pro něž sice nebyly určeny mezní hodnoty, ale jejich vypouštění do vodního prostředí je potřeba omezovat. Oba seznamy látek a jejich skupin jsou rovněž přílohou č. 1 zákona č. 254/2001 Sb.
Celkem bylo pro inventarizaci použití a emisí z průmyslu dotazováno 17 zvlášť nebezpečných závadných látek a 66 ostatních nebezpečných závadných látek nebo jejich skupin.